SHOTGUN METAGENOM

Bir numunede bulunan toplam mikrobiyal DNA’nın önceden belirlenmiş bir hedef bölgeye (örneğin 16S rRNA veya ITS) özgü amplifikasyon yapılmaksızın, rastgele fragmente edilerek yüksek kapasiteli yeni nesil dizileme (NGS) platformlarında okunmasına dayanan, hedef dışı (untargeted) ve kapsamlı bir yaklaşımdır.

Bu yöntem, amplikon tabanlı analizlerde görülebilen primer yanlılığı ve sınırlı taksonomik çözünürlük gibi kısıtları ortadan kaldırarak, örnekte bulunan bakteriler, arkeler, mantarlar, DNA virüsleri ve diğer mikrobiyal bileşenlerin eş zamanlı ve yüksek çözünürlükte karakterizasyonuna olanak tanır.